資源已經嚴重枯竭，為尋求新生的生存星球，地球聯盟派出神宮研究所的一眾人員進入茫茫的星空之中。天梭號在星空之中遭遇了無法想象的空間坍塌，神宮研究所少年文星玄給一星空生物裹著意識砸進了一巨大的大陸之中。廣闊無垠的星空深處九星閃耀。神紋大陸，以神紋為尊，只有在神府之中孕育出神紋的種子，才能開啟身體之中的九大脈輪天宮，成就先天神紋戰體。神紋分為兩大系：植系神紋和獸系神紋。植系神紋等級為：凡根神紋、靈草神紋